在反滲透係統停運5d以上時，應采取一些措施，對低壓複合膜進行保護，防止細菌在膜上滋生。反滲透低壓複合膜的短期和長期保護措施如下。
（1)短期保護措施。短期保護方法適用於停運5d以上30d以下的反滲透係統。
具體操作如下。
①用反滲透產品水衝洗反滲透係統，同時注意將氣體從係統中完全排除。
②將壓力容器及相關管路充滿水後，關閉相關閥門，防止氣體進入係統。
③每隔5d按上述方法衝洗一次反滲透係統。
（2)長期保護措施。長期停用保護方法適用於停止使用30d以上的反滲透係統。具體操作步驟如下。
①清洗係統中的膜元件。
②用反滲透產品水或除鹽水配製殺菌液，並用殺菌液衝洗反滲透係統。
③用殺菌液充滿反滲透係統後，關閉相關閥門使殺菌液保留於係統中，此時應確認係統完全充滿。
④如果係統溫度低於20℃,應每隔30d用新的殺菌液進行第二、第三步的操作；如果係統溫度高於20℃,應每隔15d更換一次保護液（殺菌液）。
⑤在反滲透係統重新投入使用前，用低壓給水衝洗係統1h,然後用高壓給水衝洗係統5~10min,無論低壓衝洗還是高壓衝洗時，係統的產水排放閥均應全部打開。在恢複係統正常操作前，應檢查並確認產品水中不含有任何殺菌劑。
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